九针,是指古代针刺治疗疾病时所用的九种不同形制的针具,即镵针、员针、针、锋针、铍针、员利针、毫针、长针、大针。十二原,是指十二原穴,即五脏各二原穴,以及膏之原穴和肓之原穴。十二原穴,是指治疗脏腑疾病的十二个腧穴。原穴之“原”,通“源”,是本源的意思。本篇主要论述了“九针”和“十二原”两方面的内容,所以篇名“九针十二原”。
本篇的主要内容包括:一、论述针刺补泻的原理和疾、徐、开、合等各种精巧手法;二、详细地介绍九针的名称、形制及其不同的治疗用途;三、简要概括针刺的取穴、深浅、补泻等原理,并指出针刺的关键是“得气”;四、介绍十二原穴的名称及其所对应的脏腑,以及脏腑发病时取相应原穴进行治疗的道理。